胃食管反流可能引发食管炎、食管溃疡、巴雷特食管甚至食管癌，危害程度从黏膜损伤到癌变逐步加重。
胃酸反复刺激食管黏膜导致炎症，表现为胸骨后灼痛、吞咽困难，可使用奥美拉唑、铝碳酸镁、雷贝拉唑抑制胃酸并保护黏膜。
长期反流使食管黏膜糜烂加深形成溃疡，可能伴随呕血黑便，需联用硫糖铝、艾司奥美拉唑和康复新液促进溃疡愈合。
食管鳞状上皮被柱状上皮替代的癌前病变，需定期胃镜监测，必要时行射频消融术或内镜下黏膜切除术干预。
巴雷特食管恶变风险显著增加，中晚期需手术联合放化疗，早期发现可通过内镜下剥离术根治。
控制体重、避免高脂饮食及餐后平卧可减少反流发作，出现吞咽梗阻或消瘦时需立即就医。
