辣木籽可能引起胃肠不适、过敏反应、低血压及肝肾功能异常等副作用，过量食用可能加重症状。
辣木籽含高纤维和生物碱，可能刺激胃肠黏膜导致腹胀、腹泻。胃肠功能较弱者应减量食用，必要时可口服蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌胶囊或奥美拉唑缓解症状。
部分人群对辣木籽中活性蛋白过敏，表现为皮肤瘙痒、皮疹。轻度过敏可服用氯雷他定片、西替利嗪胶囊或外用炉甘石洗剂，严重过敏需立即就医。
辣木籽的降压成分可能使血压偏低者出现头晕乏力。建议监测血压，避免与降压药同服，必要时调整用药方案。
长期过量摄入可能增加肝肾代谢负担，引发指标异常。服用期间需定期检查肝肾功能，避免与肾毒性药物联用。
食用辣木籽建议从少量开始测试耐受性，出现不适及时停用并咨询医生，特殊体质及慢性病患者应在医师指导下使用。
