原发性脑干损伤可能导致意识障碍、呼吸循环衰竭、运动功能障碍、言语吞咽困难以及长期认知损害。脑干是生命中枢，损伤后危害程度与损伤部位和范围密切相关。
脑干网状结构受损会引发持续性昏迷或嗜睡，部分患者出现植物状态。中脑上行激活系统受累时，可能出现昼夜节律紊乱。这类障碍直接影响患者对外界刺激的反应能力。
延髓损伤可导致中枢性呼吸衰竭，需依赖呼吸机维持。心血管调节中枢受损会引起血压剧烈波动，可能出现神经源性肺水肿。这种情况具有较高致死风险。
锥体束损伤引发偏瘫或四肢瘫，基底节区受累导致肌张力异常。小脑联系纤维损伤会造成共济失调，影响站立和行走功能。部分患者出现不自主运动。
延髓疑核损伤导致真性球麻痹，表现为饮水呛咳和构音障碍。假性球麻痹患者可出现强哭强笑。严重吞咽障碍需鼻饲饮食维持营养。
脑干与大脑联系纤维中断可能造成注意力缺陷和记忆减退。部分患者出现执行功能障碍，影响日常活动能力。情绪调节异常表现为易激惹或情感淡漠。
脑干损伤患者需进行多学科康复治疗，包括高压氧、运动疗法和吞咽训练。家属应学习正确的体位摆放和营养支持方法，预防压疮和肺炎。定期随访评估神经功能恢复情况，根据恢复阶段调整康复方案。保持环境安全，避免跌倒等二次伤害。心理支持对改善患者生活质量尤为重要。
