肛瘘通常可通过肛门周围肿痛、流脓、反复感染等症状结合专科检查确诊。诊断方法主要有肛门指诊、肛门镜检查、磁共振成像、超声检查、瘘管造影等。
1、肛门指诊医生通过戴手套的手指触诊肛门周围，可发现肛瘘外口位置及皮下条索状瘘管走向。典型体征包括触及硬结、压痛或按压时有脓液溢出。该方法简便易行但难以判断复杂瘘管走向。
2、肛门镜检查采用带有光源的肛门镜观察肛管齿状线附近，可发现肛瘘内口呈凹陷或充血状态。检查时可能见到脓性分泌物从内口渗出，同时能排除痔疮、肛裂等疾病。
3、磁共振成像盆腔磁共振能清晰显示肛瘘主支、分支与肛门括约肌的立体关系，对高位复杂性肛瘘诊断价值较高。图像可区分活动期炎症与纤维化瘘管，为手术方案制定提供依据。
4、超声检查经肛门超声通过高频探头可实时观察瘘管走向及与括约肌的关系，能准确测量瘘管长度和深度。检查无辐射且成本较低，适用于初步筛查和术后随访。
5、瘘管造影将造影剂从外口注入瘘管后拍摄X光片，可显示瘘管全程走行及是否存在分支。该方法对简单型肛瘘效果好，但造影剂可能刺激组织且无法评估周围炎症情况。
建议出现肛门肿痛、渗液等症状时尽早就诊肛肠外科。日常需保持肛门清洁，排便后可用温水坐浴，避免久坐久站。饮食宜清淡富含膳食纤维，忌辛辣刺激食物。确诊肛瘘后应根据分型选择瘘管切开术、挂线疗法等手术治疗，术后需定期换药防止假性愈合。
