自身免疫性脑炎预后差异较大，主要与抗体类型、治疗时机、基础疾病等因素有关。多数患者经免疫治疗后症状可改善，但部分可能遗留认知障碍或癫痫等后遗症。
1、抗体类型：
抗NMDAR脑炎早期干预预后较好，约75％患者功能恢复良好；而抗LGI1抗体脑炎易遗留记忆障碍。罕见抗体如抗GABABR相关脑炎复发率较高，需长期随访。
2、治疗时机：
发病4周内接受免疫球蛋白冲击或激素治疗者，症状缓解率显著提高。延迟治疗可能导致神经元不可逆损伤，增加后遗症风险。
3、基础疾病：
合并肿瘤者需同步处理原发病，未及时切除肿瘤的患者复发率可达40％。非肿瘤型患者预后相对较好，但需警惕潜在肿瘤可能。
4、症状严重度：
以精神症状起病者恢复较快，出现癫痫持续状态或昏迷的重症患者，约30％会遗留运动或语言功能障碍。儿童患者神经可塑性强于成人。
5、康复干预：
急性期后持续6-12个月的认知康复训练可改善执行功能，结合经颅磁刺激等物理治疗能提升生活质量。定期脑电图监测可预警癫痫发作。
建议康复期保持地中海饮食模式，适量补充ω-3脂肪酸有助于神经修复。每周进行150分钟中等强度有氧运动，如快走或游泳，可促进脑源性神经营养因子分泌。避免熬夜和过度疲劳，建立规律的睡眠节律。家属需关注患者情绪变化，必要时寻求专业心理支持。每3-6个月复查脑脊液抗体滴度及头颅核磁，持续监测2年以上。
