无痛肠镜检查可能出现头晕、恶心、腹胀等轻微副作用，严重时可能发生肠穿孔或麻醉相关并发症。无痛肠镜通常采用静脉麻醉，检查过程中可能出现麻醉药物过敏、呼吸抑制等风险，术后可能因肠道充气或器械操作引发短暂不适。
检查后常见腹胀、肛门不适或轻微腹痛，多与检查时注入气体扩张肠道有关，通常数小时内自行缓解。部分患者因麻醉药物残留出现头晕、乏力，建议检查后24小时内避免驾驶或高空作业。少数情况下可能因肠道结构异常或操作难度大导致黏膜损伤，表现为持续腹痛或便血，需及时就医处理。
严重并发症如肠穿孔概率极低，多与肠道病变严重程度相关，表现为剧烈腹痛、发热或腹膜刺激征。麻醉风险多见于心肺功能异常者，术前需严格评估病史。检查后应保持清淡饮食1-2天，避免辛辣刺激食物，适当活动促进气体排出。若出现持续发热、呕血或意识模糊，须立即联系医疗机构。
建议检查前充分告知医生过敏史和用药情况，术后两小时内禁食禁水，由家属陪同返家。长期服用抗凝药物者需提前遵医嘱调整用药方案，糖尿病患者应监测血糖变化。日常可增加膳食纤维摄入预防肠道疾病，40岁以上人群建议每5-10年定期筛查。
