儿童病毒性脑炎可能复发，复发原因与病毒潜伏感染、免疫缺陷、治疗不彻底等因素有关。
儿童病毒性脑炎复发通常与病毒在神经系统中潜伏感染有关，部分病毒如单纯疱疹病毒可能长期潜伏于神经节，当机体免疫力下降时重新激活导致复发。免疫缺陷患儿因无法有效清除病毒，复发概率较高。治疗过程中若未完成足疗程抗病毒治疗或未规范使用糖皮质激素，可能导致病毒未被完全清除而复发。部分患儿存在先天性免疫功能障碍或遗传易感性，也可能增加复发风险。复发时可能出现发热、头痛、呕吐、意识障碍等与初次发作类似的症状，但部分患儿症状可能更严重。
患儿康复后应定期复查脑电图和神经系统评估，避免过度疲劳和感染诱发因素，必要时在医生指导下进行免疫调节治疗。
病毒性脑炎可能导致认知障碍、运动功能障碍和癫痫等后遗症。
病毒性脑炎是病毒感染引起的脑实质炎症，部分患者在急性期过后会遗留不同程度的后遗症。认知障碍表现为记忆力减退、注意力不集中、执行功能下降等，严重者可出现痴呆症状。运动功能障碍包括肢体无力、共济失调、吞咽困难等，与脑组织损伤部位相关。癫痫发作是常见后遗症，可能表现为全面性强直阵挛发作或局灶性发作。部分患者还会遗留情绪障碍、睡眠障碍等精神行为异常。
后遗症的严重程度与病毒类型、脑损伤范围、治疗时机等因素相关。单纯疱疹病毒性脑炎后遗症发生率较高，肠道病毒性脑炎相对较轻。儿童患者可能出现发育迟滞、学习困难等长期影响。老年患者更容易出现持续性认知功能损害。及时的抗病毒治疗和康复训练有助于减轻后遗症。
建议患者定期复查神经系统功能，在医生指导下进行认知训练、运动康复等综合干预，必要时使用抗癫痫药物控制发作。
