肾盂肾炎可能并发肾周脓肿、败血症、肾乳头坏死、慢性肾功能不全等疾病，病情发展可能从局部感染扩散至全身系统损害。
1、肾周脓肿细菌突破肾盂壁向周围扩散形成脓肿，表现为持续高热和腰部剧痛，需通过穿刺引流联合抗生素治疗，常用药物包括头孢曲松、左氧氟沙星、甲硝唑。
2、败血症病原体入血引发全身炎症反应，伴随寒战及低血压，需静脉注射广谱抗生素，可选用哌拉西林他唑巴坦、亚胺培南、万古霉素。
3、肾乳头坏死肾髓质缺血导致乳头组织脱落，出现肉眼血尿和肾绞痛，需控制基础疾病并缓解梗阻，治疗药物包含坦索罗辛、布洛芬、碳酸氢钠。
4、慢性肾功能不全反复感染造成肾实质不可逆损伤，表现为水肿和血肌酐升高，需限制蛋白摄入并控制血压，常用药物有缬沙坦、呋塞米、促红细胞生成素。
急性期需严格卧床休息，每日饮水超过2000毫升，恢复期定期监测尿常规和肾功能指标。
