牙肉肿痛能否自愈取决于具体病因，轻微牙龈炎可能自愈，但牙周脓肿或龋齿继发感染通常需要医疗干预。
牙龈受到食物残渣刺激或刷牙不当造成轻微损伤时，局部红肿可能通过加强口腔清洁自行缓解。每日使用软毛牙刷配合巴氏刷牙法，用生理盐水漱口三到四次，避免进食过硬过烫食物，通常三到五天内肿胀逐渐消退。妊娠期激素变化导致的牙龈充血也可在分娩后自行改善。
当肿痛由深龋引发的根尖周炎或智齿冠周炎导致时，自愈概率显著降低。病灶区出现跳痛伴颌面部肿胀，或存在明显脓性分泌物时，提示需进行根管治疗、牙周刮治等专业处置。糖尿病患者合并牙龈脓肿可能快速进展为颌间隙感染，出现张口受限或发热症状必须立即就医。长期服用免疫抑制剂患者的口腔炎症自愈能力更差。
建议肿痛持续超过两天或伴随淋巴结肿大时及时就诊口腔科。日常可使用含氯己定的漱口水抑制菌斑，避免用患侧咀嚼，定期更换牙刷。夜间磨牙患者需佩戴咬合垫减少牙龈机械刺激，吸烟者应控制每日吸烟量以改善局部微循环。
