木棉花具有清热解毒、祛湿止痢、止血等功效，主要用于治疗泄泻、痢疾、血崩、疮毒等症状。木棉花的应用方式主要有泡茶、煎汤、外用等。
1、清热解毒木棉花性凉味甘，能有效清除体内热毒，缓解因热毒引起的咽喉肿痛、口舌生疮等症状。对于风热感冒初期出现的发热头痛，可用木棉花与金银花配伍煎汤服用。外用时可捣敷患处治疗疮疡肿毒，但皮肤溃烂者禁用。
2、祛湿止痢木棉花含有黄酮类、鞣质等成分，能收敛肠道、抑制病原微生物，对湿热型腹泻、细菌性痢疾有改善作用。临床常与马齿苋、地锦草等同用，治疗急性肠炎表现为大便黏滞、里急后重者效果较好。需注意虚寒型腹泻不宜使用。
3、止血作用木棉花中的鞣酸成分能促进血小板聚集，缩短凝血时间，对功能性子宫出血、痔疮出血等有一定疗效。治疗崩漏时可配伍仙鹤草、侧柏叶，制成煎剂分次温服。出血量多或持续不止者应及时就医。
4、抗氧化木棉花提取物含有多酚类物质，能清除自由基，减轻氧化应激损伤。适量饮用木棉花茶有助于延缓皮肤衰老，改善紫外线引起的皮肤红斑。但不宜过量饮用，以免引起胃肠不适。
5、调节免疫研究表明木棉花多糖可增强巨噬细胞吞噬能力，提高机体非特异性免疫力。在流感季节可用木棉花、菊花、桑叶配伍代茶饮，帮助预防呼吸道感染。自身免疫性疾病患者使用前应咨询医生。
使用木棉花时建议选择无污染、干燥完整的花瓣，脾胃虚寒者应减量或配伍生姜。鲜品外用可能引起接触性皮炎，建议先小面积试用。孕妇及月经量多者慎用，避免与抗凝药物同服。出现过敏反应如皮肤瘙痒、呼吸困难应立即停用并就医。日常可搭配薏苡仁、茯苓等食材煮粥，增强祛湿效果。
