BECT一般2-4年可自行缓解，多数患者在青春期前症状消失。BECT即伴中央颞区棘波的良性儿童癫痫，病程受发作频率、脑电图特征、药物治疗反应、个体发育差异、共患病情况等因素影响。
每年发作少于5次的患儿预后较好，可能在较短时间内进入缓解期。发作频繁者需更长时间观察，部分患儿需持续用药控制。家长需定期记录发作情况，配合医生调整治疗方案。
脑电图显示典型中央颞区棘波的患儿预后更佳，异常放电通常在青春期前消失。若伴随其他脑区异常放电或背景节律异常，可能延长病程。建议每6-12个月复查脑电图评估病情。
对丙戊酸钠、左乙拉西坦等抗癫痫药物敏感的患儿，症状控制更快。约30％患儿无须用药即可自愈，但频繁发作或夜间发作影响生活质量时仍需药物干预。用药期间需监测药物不良反应。
女孩症状消退时间通常早于男孩，可能与神经发育速度差异有关。认知功能正常的患儿预后优于合并学习障碍者。青春期激素变化对疾病缓解有促进作用。
合并注意力缺陷多动障碍或语言发育迟缓的患儿，可能需要更长时间达到完全缓解。此类患儿需神经科与儿科协同管理，同时关注共患病的康复治疗。
BECT患儿日常应保持规律作息，避免睡眠剥夺和过度疲劳。饮食注意均衡营养，适当增加富含维生素B6的食物如香蕉、鱼类。鼓励正常参与学习和体育活动，但需避免潜水、攀岩等高风险运动。家长应学习癫痫发作时的急救措施，定期随访神经专科，避免擅自调整药物剂量。多数患儿成年后无神经系统后遗症，不影响正常生活和工作能力。
