长期服用褪黑素可能干扰自身褪黑素分泌节律，并引发头痛、嗜睡等不良反应。褪黑素适用于短期调节睡眠节律，不建议作为常规助眠药物长期使用。
褪黑素是人体松果体自然分泌的激素，参与调节昼夜节律。外源性补充可能通过负反馈抑制机制影响自身分泌功能，导致昼夜节律紊乱。部分使用者会出现日间困倦、头晕、恶心等轻微反应，通常停药后可缓解。少数人群可能出现情绪低落、腹部不适或过敏反应，需立即停用。长期大剂量服用可能影响生殖激素水平，青少年及备孕人群应避免使用。
褪黑素对原发性失眠疗效有限，更适用于倒时差、轮班工作等昼夜节律失调情况。使用超过2-3周未见改善者应排查焦虑、甲亢等潜在病因。合并使用抗凝药、免疫抑制剂或降压药时需警惕药物相互作用。改善睡眠应优先建立规律作息，保持卧室黑暗环境，避免睡前使用电子设备。持续性失眠建议就医评估，必要时采用认知行为疗法或遵医嘱使用右佐匹克隆片等处方助眠药物。
