酵素对甲状腺功能减退症的作用有限，甲减的治疗主要通过甲状腺激素替代疗法，酵素可能通过改善消化吸收、调节肠道菌群、减轻炎症反应、辅助代谢等途径产生轻微影响。
1、改善消化吸收部分酵素可能帮助分解食物中的大分子物质，促进营养吸收，但无法替代左甲状腺素钠等药物。甲减患者常伴随胃肠蠕动减慢，消化功能减弱。
2、调节肠道菌群某些发酵类酵素可能调节肠道微生态平衡，间接影响免疫调节。肠道菌群紊乱与自身免疫性甲状腺炎相关，但证据等级较低。
3、减轻炎症反应含抗氧化成分的酵素或有助于减轻甲状腺组织炎症，但对甲状腺滤泡破坏无逆转作用。常见于桥本甲状腺炎导致的甲减。
4、辅助代谢酵素可能参与部分物质代谢过程，但无法纠正甲状腺激素缺乏导致的全身代谢率下降。需监测TSH水平调整药物剂量。
甲减患者应遵医嘱规范用药，可适量食用含天然酵素的木瓜、菠萝等新鲜水果，避免未经灭菌处理的自制酵素制品。
