多数附睾囊肿无须手术，体积较小且无症状时仅需定期观察。是否需要手术主要取决于囊肿大小、症状严重程度、是否影响生育功能以及是否合并感染等因素。
1、囊肿体积直径小于1厘米的囊肿通常无须处理，建议每6-12个月复查超声；超过3厘米或短期内快速增大的囊肿可能压迫周围组织，需考虑手术切除。
2、症状表现无症状囊肿可保守观察；若出现阴囊坠胀、疼痛或影响日常活动，经保守治疗无效时可行附睾囊肿切除术，术后需预防感染。
3、生育影响囊肿导致输精管梗阻或精液质量下降时，备孕男性建议行显微镜下囊肿剥除术，可配合精索静脉曲张结扎等联合治疗。
4、感染风险反复合并附睾囊肿感染或脓肿形成者，需在抗感染治疗后行手术引流或切除，常用术式包括附睾部分切除术。
日常应避免阴囊部位剧烈撞击，穿着宽松内裤减少摩擦，若出现囊肿突然增大或剧烈疼痛需立即就医排除睾丸扭转等急症。
