多数巴氏腺囊肿无须手术治疗，可通过保守治疗缓解。处理方式主要有热敷缓解、抗生素治疗、引流术、造口术。
1、热敷缓解早期囊肿可通过每日温水坐浴促进腺体通畅，缓解肿胀疼痛，适合无明显感染的轻微症状。
2、抗生素治疗合并感染时需口服头孢克肟、阿莫西林克拉维酸钾等抗生素，可能与细菌逆行感染有关，常伴局部红肿热痛。
3、引流术较大囊肿可在局麻下行穿刺抽液，适用于反复发作但未形成脓肿者，操作简单且创伤小。
4、造口术慢性复发病例建议行腺体开口重建术，与腺管阻塞密切相关，术后需保持会阴清洁预防粘连。
日常避免久坐压迫，选择棉质内裤减少摩擦，急性期可遵医嘱使用左氧氟沙星等药物控制感染。
