大便中出现真菌孢子可能由肠道菌群失调、免疫力低下、抗生素使用、真菌感染等原因引起，需结合粪便培养和临床症状综合判断。
1、肠道菌群失调长期高糖饮食或胃肠功能紊乱可能导致肠道环境改变，促使真菌过度繁殖。可通过补充益生菌调节菌群平衡，常用药物有双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒、地衣芽孢杆菌活菌胶囊。
2、免疫力低下HIV感染、糖尿病等基础疾病或放化疗后免疫功能受损时，易出现念珠菌等条件致病菌定植。需治疗原发病，必要时使用氟康唑胶囊、伊曲康唑胶囊、伏立康唑片等抗真菌药物。
3、抗生素使用广谱抗生素会破坏肠道正常菌群屏障，导致白色念珠菌等真菌过度生长。应在医生指导下调整用药方案，可配合布拉氏酵母菌散等真菌制剂进行生态治疗。
4、真菌感染侵袭性曲霉菌病或隐球菌病等深部真菌感染时，粪便可能检出病原体孢子。多伴有发热、腹泻等症状，需静脉使用两性霉素B脂质体、卡泊芬净等强效抗真菌药物。
日常需注意饮食卫生，避免生冷食物，免疫力低下者应定期进行粪便微生物检测，发现异常及时就医。
