囊肿是否需要手术取决于囊肿的类型、大小、位置以及是否引起症状。多数情况下体积较小且无症状的囊肿无须手术，定期观察即可；若囊肿体积较大、生长迅速、引发疼痛或压迫周围器官，通常建议手术切除。
生理性囊肿如肝囊肿、肾囊肿在直径小于5厘米且无不适时，可通过超声定期监测。卵巢囊肿若无扭转或破裂风险，且肿瘤标志物正常，多数选择3-6个月复查。皮下表皮样囊肿未感染时，仅需保持局部清洁。这类囊肿手术干预概率较低，但需警惕突然增大或形态异常。
病理性囊肿如胰腺假性囊肿合并感染、甲状腺囊肿压迫气管、巧克力囊肿导致不孕等情况需手术处理。多房性肾囊肿伴肾功能损害、肝囊肿合并胆瘘等复杂病例可能需腹腔镜或开腹手术。术后需病理检查排除恶性可能，部分囊肿如腱鞘囊肿术后存在复发风险。
囊肿患者应避免外力撞击囊肿部位，观察是否出现红肿热痛等感染征兆。饮食上减少高胆固醇食物摄入，控制体重有助于降低囊肿进展风险。术后患者需按医嘱复查影像学，伤口愈合前避免剧烈运动。若发现囊肿短期内体积变化超过50％或影响日常功能，应及时就医评估手术指征。
甲状舌管囊肿通常建议手术治疗，但部分无症状或体积较小的囊肿可暂不手术。
甲状舌管囊肿是胚胎期甲状舌管残留形成的先天性颈部肿物，若囊肿体积小且无感染、压迫症状，可定期观察。临床建议每3-6个月通过超声监测囊肿变化，同时注意避免颈部外伤和呼吸道感染。对于儿童患者，若囊肿未影响吞咽或呼吸功能，可暂缓手术至4岁后实施。
当囊肿反复感染、直径超过2厘米或导致呼吸困难、吞咽障碍时，需行甲状舌管囊肿切除术。手术需完整切除囊肿及相连的甲状舌管，否则易复发。合并急性感染时需先抗感染治疗，常用药物包括头孢克洛干混悬剂、阿莫西林克拉维酸钾片、左氧氟沙星片等。
日常应保持颈部清洁，避免挤压囊肿，出现红肿热痛等感染征象需及时就医。
