植发手术可能存在毛囊炎、瘢痕形成、术后肿胀、感染、毛发生长不良等后遗症，但多数可通过规范操作和术后护理避免。植发属于微创手术，风险相对可控，但需选择正规医疗机构并严格遵循医嘱。
毛囊炎是植发后较常见的并发症，主要表现为移植区红肿疼痛，与毛囊周围细菌感染或排异反应有关。术后需保持头皮清洁干燥，避免抓挠，轻度症状可通过碘伏消毒缓解，严重时需口服头孢克肟分散片等抗生素。瘢痕形成多发生于疤痕体质患者，取发区可能遗留线状瘢痕，采用FUE无痕技术可显著降低概率。术后24-48小时可能出现前额、眼周水肿，与麻醉液扩散和局部淋巴回流受阻相关，冰敷和抬高头部能加速消退。感染风险与术中消毒不彻底有关，表现为发热、脓性分泌物，需及时使用阿莫西林克拉维酸钾片控制。约5%患者会出现毛囊存活率低或新生毛发细软，与供体毛囊质量、术后血供不足相关，必要时需二次加密手术。
极少数情况下可能发生神经损伤导致局部感觉异常，通常3-6个月自行恢复。过敏体质者可能对麻醉药物或消毒剂产生过敏性皮炎，术前应详细告知医生过敏史。取发区若过度提取可能导致永久性毛发稀疏，需严格控制单次移植数量。术后1-3个月可能出现休止期脱发，属于正常生理现象。罕见情况下会发生动静脉瘘或切口愈合不良，需手术修复。
术后1周内避免剧烈运动、桑拿及辛辣饮食，睡眠时垫高枕头减轻水肿。移植区结痂应自然脱落，不可强行剥离。3个月内避免暴晒和染烫头发，使用温和洗发水清洁。定期回访复查毛囊存活情况，出现持续红肿、异常脱发需及时就医。保持均衡饮食，适量补充蛋白质、维生素B族和锌元素有助于毛发生长。术后6-12个月为最终效果评估期，期间保持良好作息和减压心态对恢复至关重要。