舌头后两侧疼痛可能由局部刺激、口腔溃疡、舌咽神经痛、舌炎等原因引起，需结合具体症状判断病因。
1. 局部刺激进食过热、过硬食物或辛辣刺激物可能导致舌后部黏膜损伤，表现为短暂性灼痛。无须特殊治疗，避免刺激食物后多可自行缓解。
2. 口腔溃疡复发性阿弗他溃疡好发于舌缘，呈现圆形糜烂面伴明显触痛。可能与维生素缺乏、免疫因素有关，可使用西地碘含片、重组人表皮生长因子凝胶、复方氯己定含漱液等药物。
3. 舌咽神经痛突发性电击样疼痛可能与血管压迫神经有关，疼痛常放射至耳部。卡马西平、加巴喷丁、普瑞巴林等药物可缓解症状，严重者需神经阻滞治疗。
4. 舌炎真菌或细菌感染可能导致舌乳头萎缩性炎症，伴随味觉异常。维生素B族缺乏性舌炎需补充复合维生素B，感染性舌炎需对应使用制霉菌素、阿莫西林等药物。
保持口腔清洁，避免吸烟饮酒，饮食宜温凉软烂。若疼痛持续超过一周或伴随吞咽困难需及时就诊。
