胃镜和肠镜的难受程度因人而异，胃镜可能因咽喉刺激引发较强不适，肠镜则因肠道充气扩张产生腹胀感。两种检查的不适感主要与操作方式、个人耐受度及术前准备有关。
胃镜检查需经口插入内镜，多数患者会出现咽喉异物感、恶心呕吐等反应，尤其对咽反射敏感者更明显。检查前需空腹8小时以上，咽喉麻醉可减轻插管不适，但部分人仍会因器械摩擦食管产生灼热感。术中医生注气扩张胃腔时可能引发短暂胀痛，全程约5-10分钟，配合深呼吸能有效缓解紧张。
肠镜检查通过肛门进镜，术前需严格清肠准备，服用泻药可能引起腹痛乏力。检查时肠道注气会带来持续腹胀甚至绞痛，尤其在镜身通过肠道弯曲部位时。但现代无痛肠镜已普及静脉麻醉，睡醒即完成检查。普通肠镜全程约20-30分钟，过程中变换体位有助于进镜，术后排气可快速缓解腹胀。
检查后2小时内避免进食过热食物，肠镜后需观察有无持续腹痛或便血。选择经验丰富的操作医师、检查前充分沟通、术中保持放松都能显著降低不适感。根据症状需求优先选择针对性检查，必要时可考虑无痛麻醉方案。
月经期间一般可以做胃镜，但存在经量过多或严重痛经时需暂缓检查。胃镜检查本身不受月经周期影响，主要考虑因素是患者耐受性和出血风险。
月经期女性凝血功能可能轻微波动，但常规胃镜检查不会显著增加出血风险。胃镜操作仅涉及上消化道观察或活检，与子宫内膜无直接关联。检查前需告知医生月经情况，医生会评估血红蛋白水平及整体状态。多数医疗机构允许月经期患者按原计划接受检查，尤其针对急症或肿瘤筛查等必要情况。
部分女性经期伴随严重贫血或剧烈腹痛，可能影响检查配合度。大量使用卫生棉条者需提前取出，避免检查体位变动导致泄漏。对痛经敏感者可选择非经期检查，减少不适叠加风险。既往有经期晕厥史或出血性疾病患者应主动告知必要时调整检查时间。
检查前保持正常饮食禁忌，避免经期过度节食诱发低血糖。术后两小时禁食期间可使用暖水袋缓解腹痛，注意观察阴道出血与消化道出血的区别。建议选择月经量较少的第3-5天进行检查，携带卫生用品备用。检查后出现异常腹痛或头晕需及时联系医护人员，排除其他急腹症可能。
