胃镜和肠镜的难受程度因人而异，胃镜可能因咽喉刺激引发较强不适，肠镜则因肠道充气扩张产生腹胀感。两种检查的不适感主要与操作方式、个人耐受度及术前准备有关。
胃镜检查需经口插入内镜，多数患者会出现咽喉异物感、恶心呕吐等反应，尤其对咽反射敏感者更明显。检查前需空腹8小时以上，咽喉麻醉可减轻插管不适，但部分人仍会因器械摩擦食管产生灼热感。术中医生注气扩张胃腔时可能引发短暂胀痛，全程约5-10分钟，配合深呼吸能有效缓解紧张。
肠镜检查通过肛门进镜，术前需严格清肠准备，服用泻药可能引起腹痛乏力。检查时肠道注气会带来持续腹胀甚至绞痛，尤其在镜身通过肠道弯曲部位时。但现代无痛肠镜已普及静脉麻醉，睡醒即完成检查。普通肠镜全程约20-30分钟，过程中变换体位有助于进镜，术后排气可快速缓解腹胀。
检查后2小时内避免进食过热食物，肠镜后需观察有无持续腹痛或便血。选择经验丰富的操作医师、检查前充分沟通、术中保持放松都能显著降低不适感。根据症状需求优先选择针对性检查，必要时可考虑无痛麻醉方案。
