疱疹性咽峡炎一般不会直接导致手足口病，但两者均由肠道病毒感染引起，可能存在交叉感染风险。疱疹性咽峡炎主要由柯萨奇病毒A组感染所致，手足口病则多由肠道病毒71型或柯萨奇病毒A16型引起。
疱疹性咽峡炎和手足口病属于不同亚型的肠道病毒感染，病原体存在差异。疱疹性咽峡炎主要表现为咽部疱疹、发热等症状，病变集中在口腔后部；手足口病则会在口腔、手、足等部位出现疱疹或皮疹，部分病例可能伴有神经系统并发症。两种疾病的传播途径相似，均通过密切接触或飞沫传播，若儿童同时接触不同病毒株，可能先后发病。
极少数情况下，疱疹性咽峡炎患儿可能因免疫应答异常或合并其他肠道病毒感染，出现手足口病样皮疹。这种情况通常与个体免疫状态或病毒变异有关，并非疱疹性咽峡炎直接转化所致。临床观察发现，柯萨奇病毒A6型感染可能引起非典型手足口病，其皮疹分布更广泛，但这类病例占比很低。
预防交叉感染需做好隔离防护，患儿应避免与其他儿童密切接触。家长需注意观察病情变化，若出现手掌、足底皮疹或持续高热，应及时就医排查手足口病。日常加强洗手消毒、玩具清洁，接种EV71疫苗可有效预防重症手足口病，但对疱疹性咽峡炎无保护作用。
