细菌性脑膜炎可能引发脑水肿、脑积水、听力丧失等并发症，部分患者会遗留癫痫、认知障碍等后遗症。
细菌性脑膜炎的急性期并发症主要由病原体直接侵袭或炎症反应导致。脑水肿因血脑屏障破坏引发颅内压增高，表现为头痛、呕吐甚至昏迷。脑积水多见于婴幼儿，因蛛网膜颗粒粘连阻碍脑脊液循环。约20％患者出现感音神经性耳聋，与细菌毒素损伤耳蜗毛细胞有关。其他并发症还包括硬膜下积液、脑脓肿以及弥漫性血管内凝血等全身性损害。
后遗症多与脑实质不可逆损伤相关。癫痫发作源于皮层瘢痕形成，需长期服用抗癫痫药物控制。认知功能障碍常见于前额叶、海马区受损者，表现为记忆力减退或执行功能下降。儿童可能遗留发育迟缓、学习困难，成人可能出现性格改变或情感障碍。少数重症患者会遗留偏瘫、失语等神经系统缺陷。
患者康复期需定期复查脑电图、听力测试等，配合神经营养药物和康复训练，注意预防呼吸道感染以免病情反复。
