乳糖不耐受患者、牛奶蛋白过敏者、胆囊疾病患者、胃肠术后恢复期人群及特定服药者不宜喝牛奶。牛奶可能引发腹胀腹泻、过敏反应或干扰药物吸收，需根据个体情况调整饮食。
乳糖不耐受患者体内缺乏乳糖酶，无法分解牛奶中的乳糖。未消化的乳糖进入结肠后经细菌发酵，会产生大量气体和短链脂肪酸，导致腹胀、肠鸣、腹泻等症状。这类人群可选择无乳糖牛奶或酸奶替代，酸奶中的乳酸菌已预先分解部分乳糖。急性发作期可口服乳糖酶胶囊辅助消化，但长期仍需避免高乳糖饮食。
免疫系统将牛奶中的酪蛋白或乳清蛋白识别为有害物质时，会引发过敏反应。婴幼儿多见IgE介导的速发型过敏，表现为荨麻疹、呕吐甚至过敏性休克；成人常见非IgE介导的迟发型过敏，以湿疹、腹痛为主。确诊需进行食物激发试验，治疗需严格回避牛奶及制品，可选择深度水解蛋白配方奶粉或植物奶替代。
胆囊炎、胆结石患者消化脂肪能力下降，而全脂牛奶含大量饱和脂肪需胆汁乳化。摄入后可能诱发胆绞痛，表现为右上腹剧痛伴肩背放射痛。急性发作期应禁食牛奶，缓解期可少量饮用脱脂牛奶。合并胰腺炎时更需限制，因牛奶中的钙可能与脂肪酸结合形成钙皂，加重脂肪泻症状。
胃大部切除或肠道手术后早期，消化功能未恢复时饮用牛奶可能引发倾倒综合征。高渗的牛奶快速进入小肠，导致血管内液体外渗，出现心悸、出汗、腹泻等表现。建议术后1-2个月逐步尝试少量低脂牛奶，同时配合胰酶肠溶胶囊帮助消化。肠梗阻患者则应完全禁食牛奶等产气食物。
服用四环素类抗生素如盐酸多西环素片时，牛奶中的钙离子会与药物结合形成不溶性复合物，降低药效。抗骨质疏松药阿仑膦酸钠片需空腹服用，牛奶会影响其吸收率。铁剂如琥珀酸亚铁片与牛奶同服会生成难溶物，建议间隔2小时。结核病患者服用利福平胶囊期间也应避免大量饮奶。
特殊人群饮用牛奶前建议咨询医生或营养师，乳糖不耐受者可尝试从50毫升开始逐步增量，观察耐受情况。选择替代品时注意钙和维生素D的补充，如强化豆奶、杏仁奶等。出现过敏反应需立即停用并服用氯雷他定片等抗组胺药物，严重时及时就医。日常饮食可增加绿叶蔬菜、豆腐等高钙食物，配合适度晒太阳促进维生素D合成。
