肠镜检查过程中是否疼痛因人而异，多数患者描述为可耐受的胀痛或牵拉感，少数敏感体质者可能感到明显不适。肠镜疼痛程度主要与肠道弯曲度、检查操作技巧、个体痛阈差异等因素相关。
多数情况下，普通肠镜的疼痛感类似严重腹胀或排便时的绞痛，主要出现在肠镜通过肠道弯曲部位或注气扩张肠腔时。这种不适通常短暂且可随操作者手法调整缓解。检查前服用解痉药物、配合深呼吸放松腹部肌肉能显著减轻不适感。部分医疗机构会采用水浸法替代传统注气法，进一步降低检查时的胀痛感。
少数对疼痛敏感或存在肠粘连的患者可能出现较剧烈的疼痛，这类情况多见于既往有腹部手术史、盆腔炎症或肠易激综合征患者。当肠镜通过乙状结肠与脾曲等生理弯曲处时，可能引发持续数秒的锐痛。某些特殊解剖结构如肠道冗长、憩室病等也会增加操作难度和不适感。这类人群可选择无痛肠镜，通过静脉麻醉实现无感检查。
建议检查前与医生充分沟通自身疼痛耐受情况，焦虑情绪会放大痛觉感知。检查过程中保持稳定的腹式呼吸，及时向操作医生反馈不适感以便调整进镜手法。术后适当走动促进排气，两小时内避免进食产气食物。对于疼痛阈值较低或存在复杂肠道病变者，优先考虑无痛肠镜检查方案。
