EMR的手术适应症主要包括消化道早期癌变、癌前病变、良性肿瘤等病变。EMR主要适用于直径小于20毫米的黏膜层病变、高级别上皮内瘤变、局限于黏膜层的早期胃癌或食管癌等。
EMR适用于局限于黏膜层的早期消化道癌变，如早期食管癌、早期胃癌、早期结直肠癌等。这些病变尚未侵犯黏膜下层，通过内镜下黏膜切除术可达到根治效果。早期癌变在病理学上表现为高级别上皮内瘤变或黏膜内癌，EMR治疗后可获得完整病理标本，有助于准确评估病变范围和浸润深度。
EMR适用于具有恶变潜能的癌前病变，如Barrett食管伴高级别上皮内瘤变、胃腺瘤伴高级别上皮内瘤变、结直肠腺瘤伴高级别上皮内瘤变等。这些病变具有较高恶变概率，通过EMR切除可阻断癌变进程。癌前病变在内镜下常表现为平坦型或轻微隆起型病变，边界清晰，适合进行黏膜切除术。
EMR适用于部分消化道良性肿瘤，如较大的胃或结肠息肉、平滑肌瘤、脂肪瘤等。对于直径超过10毫米的广基息肉或无法通过常规息肉切除术完整切除的病变，EMR可提供更完整的切除效果。良性肿瘤在内镜下表现为黏膜下隆起，表面黏膜完整，EMR可完整切除病变并保留消化道结构完整性。
EMR适用于部分局限于黏膜层的黏膜下病变，如类癌、神经内分泌肿瘤等。这些病变起源于黏膜下层但未突破黏膜肌层，通过EMR可获得完整切除。黏膜下病变在内镜下表现为黏膜下隆起，表面黏膜光滑，超声内镜检查可明确病变层次，为EMR治疗提供依据。
EMR还适用于部分特殊类型的消化道病变，如侧向发育型肿瘤、浅表扩散型早期癌等。这些病变具有特殊的生长方式，传统内镜治疗难以完整切除，EMR可通过分片切除或扩大切除范围实现病变的完整切除。特殊类型病变在内镜下表现为平坦型或浅表扩散型，边界不清，需要特殊标记和切除技术。
EMR术后需要注意饮食管理，术后24小时内禁食，随后逐步过渡到流质、半流质饮食，避免辛辣刺激性食物。术后1周内避免剧烈运动和重体力劳动，保持大便通畅。定期复查内镜评估治疗效果，监测有无复发。EMR治疗消化道病变具有创伤小、恢复快等优势，但需要严格掌握适应症，由经验丰富的内镜医师操作，以获得最佳治疗效果。
