阴茎根部出现小疙瘩可能是毛囊炎、尖锐湿疣等疾病引起的。患者应根据自身情况选择合适的治疗方式。1.毛囊炎:如果平时不注意个人卫生或经常穿紧身内裤,可能会导致局部皮肤受到细菌感染而引起炎症反应,在临床通常会出现红色丘疹,并伴有瘙痒症状。此时可以在医生指导下涂抹红霉素软膏进行消炎止痛改善病情;也可以遵医嘱服用阿莫西林胶囊辅助治疗。2.尖锐湿疣:该病是由人乳头瘤病毒感染所引发的一种性传播疾病,主要通过性接触的方式传染给他人。在发病期间一般会表现为单个或者多个淡青色的小颗粒,随着病情的发展还会逐渐增大呈鸡冠状或者是菜花状改变。可以到医院采取激光手术的方法将疣体切除掉,同时还需要配合咪喹莫特霜外涂缓解不适的症状。除此之外也有可能是皮脂腺异位症等原因造成的,建议及时就医明确病因后对因治疗。