嗜酸性粒细胞性胃肠炎多数情况下可通过规范治疗控制症状，但完全根治概率较低。治疗方式主要有糖皮质激素治疗、饮食管理、免疫调节治疗、生物制剂治疗。
泼尼松、布地奈德等糖皮质激素是首选药物，可抑制嗜酸性粒细胞浸润，缓解腹痛腹泻症状，需根据病情调整剂量。
排除过敏原是关键措施，建议采用要素饮食或剔除牛奶、鸡蛋等常见致敏食物，必要时进行食物激发试验明确过敏原。
硫唑嘌呤、甲氨蝶呤等免疫抑制剂适用于激素依赖或耐药患者，需监测骨髓抑制等不良反应。
奥马珠单抗等靶向药物可特异性阻断IgE通路，对部分难治性病例有效，但需评估治疗费用与获益。
患者应定期复查血常规与内镜，记录饮食日记，避免接触已知过敏原，出现症状加重时及时复诊调整治疗方案。
