大蒜对部分疾病可能有一定的辅助治疗作用，如轻度感染、高脂血症等，但不能替代正规医疗。大蒜的主要活性成分大蒜素具有抗菌、抗炎、调节血脂等作用，常用于辅助改善以下情况。
大蒜素对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌有抑制作用。由细菌感染引起的轻度咽喉炎、口腔溃疡等，适当食用大蒜可能有助于缓解症状。但严重感染如肺炎、败血症等需及时就医，不可依赖大蒜治疗。
大蒜可能通过抑制胆固醇合成帮助调节血脂。高脂血症患者日常可适量食用生蒜或大蒜提取物辅助降脂，但需配合医生开具的阿托伐他汀钙片、非诺贝特胶囊等药物，并定期监测血脂水平。
大蒜提取物对白色念珠菌等真菌有一定抑制作用。足癣、体癣等浅表真菌感染可尝试局部涂抹大蒜汁辅助治疗，但顽固性真菌感染需使用硝酸咪康唑乳膏、联苯苄唑乳膏等抗真菌药物。
大蒜能刺激胃液分泌，改善食欲不振、腹胀等症状。胃肠功能紊乱者可少量食用醋泡大蒜辅助消化，但胃溃疡患者应避免生蒜刺激，需服用奥美拉唑肠溶胶囊、铝碳酸镁咀嚼片等药物保护胃黏膜。
大蒜的抗氧化作用可能延缓动脉粥样硬化进展。高血压、冠心病患者可日常适量食用大蒜，但需严格遵医嘱服用苯磺酸氨氯地平片、单硝酸异山梨酯缓释片等药物控制病情。
大蒜作为食品每日摄入量建议不超过3瓣，过量可能刺激胃肠黏膜。生蒜捣碎后静置10分钟能更好保留大蒜素活性。特殊人群如术前患者、服用抗凝药物者需谨慎食用。出现明确疾病症状时应优先就医，不可将大蒜作为主要治疗手段。日常饮食中可搭配洋葱、生姜等具有类似保健作用的食材，保持营养均衡。
