美瞳和隐形眼镜的危害程度取决于使用方式和个体差异，不规范使用时美瞳可能对眼睛造成更大伤害。
美瞳由于带有色素层，透氧性通常低于普通隐形眼镜，长期佩戴可能导致角膜缺氧，引发角膜水肿或新生血管。美瞳的色素直接接触角膜可能增加过敏反应概率，劣质产品色素脱落还可能机械性磨损角膜。美瞳中央透明区若设计不当会缩小有效视野，夜间佩戴可能影响视力。部分美瞳含水量过高会加速泪液蒸发，加重干眼症状。美瞳的染色工艺不合格时，化学物质残留可能引发结膜炎或角膜炎。
普通隐形眼镜材质选择更多样，高透氧硅水凝胶产品能减少缺氧风险。无色素层设计降低过敏概率，镜片边缘处理更精细可减少机械刺激。但长时间超时佩戴仍会导致角膜上皮损伤，护理不当可能引发感染性角膜炎。近视矫正型隐形眼镜度数不准确可能加重视疲劳，部分材质吸水性差会加剧眼干症状。游泳或洗澡时佩戴可能增加棘阿米巴原虫感染风险。
建议选择有医疗器械注册证的产品，每日佩戴不超过8小时。注意镜片清洁消毒，使用专用护理液浸泡。出现眼红、眼痛或视力模糊立即停戴并就医。定期进行眼科检查，框架眼镜与隐形眼镜交替使用。避免购买非正规渠道产品，美瞳优先选择短周期抛弃型。护理液开封后三个月内用完，不可重复使用或混用不同品牌。