肾穿刺活检的禁忌症主要包括慢性肾衰竭患者肾脏彩超提示肾脏长径小于9.0厘米,实质厚度小于1.0厘米,明显的出血倾向,例如血小板明显下降,凝血功能明显异常,术前应用抗凝或抗血小板药物,重度高血压主要是指血压大于160/100毫米汞柱。孤立肾,肾脏位置过高或游走肾,肾脏结构异常,例如血管瘤,大的肾囊肿,异位肾,马蹄肾等等。体位不良包括过度肥胖,大量胸腹水,患者情况不允许翻身等。肾脏感染,例如活动性肾盂肾炎,肾脓肿,肾盂积水,肾结核,肾周脓肿等等,精神疾病不能配合肾穿刺。此外还有其他一些的情况,例如心衰,休克,严重贫血,还有妊娠的部分患者。肾穿刺活检的并发症主要包括血尿,肾周血肿,动静脉瘘,感染,误穿其他脏器等等。