牛肉干在制作过程中会损失部分营养，但依然保留大部分蛋白质和矿物质等核心营养成分。
牛肉干在制作过程中需要经过腌制、风干或烘烤等步骤，这些加工方式会导致水溶性维生素如维生素B族部分流失，尤其是维生素B1和B6对高温较为敏感。同时长时间脱水也会使牛肉中的水分含量大幅降低，导致体积缩小，但蛋白质、铁、锌等矿物质因性质稳定得以较好留存。传统风干工艺温度较低，对营养破坏较少；而高温快速烘干可能加剧维生素损失，但无论哪种工艺，牛肉干仍属于高蛋白、高矿物质的便携食品。
部分厂家为延长保质期或改善口感会添加糖、盐及食品添加剂，可能增加钠含量或额外热量。自制牛肉干可控制添加剂使用，选择低温风干方式能最大限度保留营养。食用时需注意牛肉干质地较硬，消化功能较弱者应少量分次食用，避免过量摄入蛋白质加重肾脏负担。搭配新鲜蔬菜水果可补充加工中损失的维生素，使营养摄入更均衡。
建议选择配料表简单、添加剂少的牛肉干产品，避免长期作为单一蛋白质来源。日常可将牛肉干作为运动后补充或应急食品，同时保持多样化饮食结构，确保各类营养素全面摄入。储存时需密封防潮，开封后尽快食用以保证品质。
