莫匹罗星软膏一般不用于治疗痤疮。痤疮主要由毛囊皮脂腺慢性炎症引起，而莫匹罗星软膏是一种局部抗生素，适用于细菌性皮肤感染如脓疱疮、毛囊炎等。
莫匹罗星软膏的主要成分为莫匹罗星钙，通过抑制细菌蛋白质合成发挥抗菌作用，对金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌等革兰阳性菌有较好效果。但痤疮的发病机制涉及皮脂分泌过多、毛囊角化异常、痤疮丙酸杆菌繁殖及炎症反应等多重因素，单纯抗菌治疗难以全面改善。痤疮丙酸杆菌属于厌氧菌，对莫匹罗星的敏感性较低，且该药无法调节皮脂分泌或改善毛囊角化。临床治疗痤疮更常选用维A酸类、过氧化苯甲酰、水杨酸等具有抗炎、溶解角质或调节皮脂分泌作用的药物。
若误用莫匹罗星软膏治疗痤疮，可能因药物覆盖导致毛囊堵塞加重，甚至引发接触性皮炎等不良反应。对于合并细菌感染的炎性痤疮，医生可能短期联用抗生素，但多选择克林霉素磷酸酯凝胶、夫西地酸乳膏等对痤疮丙酸杆菌更敏感的外用制剂。
出现痤疮时应根据皮损类型选择针对性治疗方案。轻度痤疮可使用阿达帕林凝胶联合过氧化苯甲酰乳膏，中重度痤疮需在医生指导下口服多西环素片或异维A酸软胶囊。日常需保持面部清洁，避免挤压皮疹，饮食上减少高糖高脂摄入，保证充足睡眠有助于控制病情发展。
