大蒜具有一定的杀菌作用，其含有的蒜素等活性成分能抑制部分细菌生长，但无法替代药物治疗感染性疾病。
大蒜中的蒜素由蒜氨酸酶分解产生，对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌有抑制作用。体外实验显示蒜素可破坏细菌细胞膜结构，干扰其代谢过程。日常食用生蒜或蒜泥时，口腔和消化道会接触少量蒜素，可能对幽门螺杆菌等胃肠病原体产生一定抑制效果。流行病学研究发现长期食用大蒜地区部分感染性疾病发病率较低。
大蒜的杀菌效果受多种因素限制。蒜素在高温烹饪中易分解，熟蒜抗菌作用显著减弱。人体吸收的蒜素浓度远低于体外实验有效浓度，难以达到治疗剂量。对于已发生的细菌感染，大蒜不能替代抗生素清除病原体。严重感染如肺炎、败血症等必须规范使用抗菌药物，避免延误病情。
建议将大蒜作为饮食保健辅助，每日食用1-2瓣生蒜即可。胃肠敏感者应控制摄入量，避免刺激黏膜。出现明确感染症状时须及时就医，严格遵医嘱用药。保持膳食多样性，配合适量运动、规律作息等健康生活方式，才能更好维持机体免疫力。
