真菌性食管炎的治疗疗程一般在2-4周不等。由于个人体质、病情严重程度不同,所以具体的用药和治疗时间也会有所不同。1.轻度:对于症状比较轻微的人群,比如只是出现了轻微的腹痛以及腹泻等症状,并没有出现其他不适的症状,可以遵医嘱服用抗真菌类药物进行治疗,比如伊曲康唑胶囊、氟康唑片等,在一定程度上能够达到治疗疾病的目的。通常需要服药两周左右的时间,如果期间恢复良好,则不需要继续服药。2.重度:如果患者的病情比较严重,已经出现了吞咽困难的情况,而且还有可能会伴有恶心呕吐等情况,此时可能需要服用药物的时间会相对延长一些,大约需要四周的时间。建议患者平时要注意饮食清淡,避免吃辛辣刺激的食物,以免加重病情。同时还要注意休息,保证充足的睡眠,避免熬夜。另外,患者还需要定期到医院复查,了解身体的恢复情况。